林学中心在《The Plant Journal 》发表毛竹研究成果
发布时间 :2017-05-11 浏览次数:
林学中心在《The Plant Journal 》发表毛竹研究成果
发布时间:2017-05-11 14:15:09
 

毛竹是生长最快的植物之一,福建是毛竹的主要产区,研究其快速生长机制具有重要的理论意义和实际应用价值。毛竹地下茎系统运输养分是茎秆快速生长的重要保障,但生长发育的调控机制尚未开展研究。2017510日,海峡联合研究院林学中心顾连峰课题组与马留银课题组合作在《The Plant Journal》杂志上在线发表题为“Comprehensive profiling ofrhizome-associated alternative splicing and alternative polyadenylation in mosobamboo (Phyllostachys edulis)”的文章(DOI:10.1111/tpj.13597,全面解析了选择性拼接和选择性多聚腺苷酸化在毛竹地下茎组织生长发育中的调控。



该研究采用PacBio第三代单分子测序,并结合RNA-seqPAS-seq (polyadenylation sitesequencing)对毛竹地下系统几个关键组织的选择性拼接和选择性多聚腺苷酸化进行了全面解析量化发现二者相互关联调控转运蛋白、转录因子、纤维素合成酶及翻译调节因子等相关基因,调控毛竹地下茎不同组织生长发育。该研究对毛竹基因进行重注释,并发现一批新的编码基因及非编码RNA,并对富含DNA甲基化的转座子侧翼选择性多聚腺苷酸化的表观遗传学调控进行了初步的探索,该成果为后续研究毛竹转录后调控及表观遗传学与快速生长的关系奠定了重要的前期基础。



我校为该论文第一单位与通讯单位。林学中心研究生王涛涛、王汇源及蔡大伟为共同第一作者,马留银副教授与顾连峰教授为共通讯作者。高宇帮张航晓和王永生也参与本项目相关工作。该项研究得到国家重点研发计划国家自然科学基金及福建省自然科学基金的资助。

论文链接:http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/tpj.13597/full